要办理角膜内皮显微镜在加拿大的MDL（Medical Device License）认证，您可以按照以下步骤进行：

1. 准备申请文件：在进行认证申请之前，准备相关的申请文件，包括产品说明、技术规格、性能评估报告、制造流程、质量控制信息等。这些文件应当清楚地描述角膜内皮显微镜的设计、功能、安全性和性能特点。

2. 确定认证分类：确定角膜内皮显微镜所属的认证分类。加拿大医疗器械局（Health Canada）将医疗器械分为四个类别：Class I、Class II、Class III和Class IV。确定正确的分类将有助于确定适用的认证要求和路径。

3. 进行认证申请：根据确定的认证分类，填写相应的申请表格，提交申请文件，并支付相关的申请费用。您的申请将会经过审核和评估，以确定角膜内皮显微镜是否符合加拿大的安全和性能标准。

4. 审核和评估过程：加拿大医疗器械局将对您的申请文件进行审核和评估。他们会考虑文件的完整性、产品的安全性和性能等方面的评估。

5. 认证批准和许可证颁发：如果您的申请通过了审核和评估，并符合相关的要求，加拿大医疗器械局将批准并颁发MDL许可证给您，证明角膜内皮显微镜符合加拿大国内的医疗器械监管要求。您将获得一个唯一的MDL号码，以标识您的产品在加拿大市场上合法销售和使用。

请注意，以上步骤仅为一般指导，具体的认证流程可能会因产品类型、规模和其他因素而有所不同。建议您与加拿大医疗器械局或专业的医疗器械认证咨询机构联系，获取最新和准确的信息，确保角膜内皮显微镜成功获得加拿大MDL认证。