确保马来西亚授权代表会保护您的商业机密和利益是非常重要的，特别是在涉及医疗器械注册等敏感事项时。以下是一些方法，可以帮助您确保授权代表会维护您的商业机密和利益：

1. **签订合同：** 在与授权代表达成合作之前，确保签订详细的合同，明确双方的权利、义务和责任。合同应包括保密条款，明确授权代表的保密责任。

2. **保密协议：** 另外可以签订专门的保密协议，明确授权代表在处理您的商业机密时需要遵守的规定。

3. **限制访问：** 限制授权代表只能访问与医疗器械注册有关的必要信息，不提供不必要的商业机密。

4. **分阶段提供信息：** 将商业机密信息分阶段提供给授权代表，确保只有在必要时才披露重要信息。

5. **文件控制：** 确保所有提供给授权代表的文件和信息都得到适当的控制和保护，避免泄露。

6. **选择可信赖的代表：** 选择有良好声誉和信誉的授权代表，通过背景调查、客户参考和口碑来确认他们的可靠性。

7. **知识产权保护：** 如果商业机密涉及知识产权，如专利、商标等，确保在与授权代表合作时采取必要的法律措施，以保护您的权益。

8. **定期审查和报告：** 跟踪授权代表的工作进展，定期审查他们的行为和合作情况，确保商业机密得到适当的保护。

9. **法律咨询：** 在涉及重要商业机密时，可以咨询法律专家，了解如何最好地保护您的权益。

10. **合作伙伴关系：** 建立信任和透明的合作伙伴关系，与授权代表保持积极的沟通，共同理解保密责任和利益。

总之，确保马来西亚授权代表会保护您的商业机密和利益需要采取一系列措施，从合同签订到信息控制，以确保您的机密信息得到适当的保护，同时与授权代表建立良好的合作关系。